“INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA”
Director: Dr. Daniel Germán Kurth
Coordinador: Dr. Daniel Germán Kurth.
Plantel Docente: Dr. Daniel Germán Kurth, Dr. Javier M. González, Dr. Pedro Eugenio Sineli, Dr. Eduardo Castro-Nallar, Dr. Lucas Damian Daurelio.
Colaboradores: Lic. Virginia Marcelino, Lic. Hayde Saracho.
Contenidos mínimos
Contenidos mínimos: 1. Módulo teórico: Introducción a la bioinformática: sistemas operativos, trabajo en la nube. Biología molecular: estructura y función de ADN, ARN y proteínas. Secuenciación de ADN, bases de datos biológicas y herramientas bioinformáticas. Alineamiento de secuencias y filogenia. Fundamentos de programación en bioinformática. Introducción al lenguaje Python. Introducción a las técnicas ómicas: genómica, transcriptómica, proteomica. Bioinformática estructural y predicción de proteínas. 2. Módulo práctico: Exploración y configuración de entornos de trabajo (Linux Ubuntu, Python y R). Acceso a bases de datos en línea. Búsqueda de secuencias en bases de datos (NCBI, UniProt). Uso de BLAST para comparación de secuencias. Scripts básicos para manejo de secuencias biológicas. Manipulación de datos con EMBOSS, Biopython y/o Bioconductor. Lectura y escritura de archivos FASTA. Alineamiento múltiple de secuencias (Clustal Omega, MUSCLE). Construcción de árboles filogenéticos (MEGA, PhyML). Ensamblaje y anotación de un genoma pequeño. Análisis de datos RNA-Seq con Python y/o R. Análisis de datos de proteómica. Modelado de proteínas con AlphaFold y/o Swiss-Model.
Información del Curso
Dr. Daniel Kurth PROIMI-CONICET Av. Belgrano y Pje. Caseros T4001MVB - Tucumán - Argentina Tel: 54 381 4344888 int 22 dkurth@conicet.gov.ar