Metagenómica: Aplicaciones de las Tecnologías de Secuenciación Masiva

Modulo Teórico: Tecnologías de secuenciación y su impacto en la ecología microbiana. Estrategias de secuenciación: amplicones, Whole Genome Shotgun (WGS). Procesamiento de datos: Ensamblado y anotación. Metagenómica funcional. Aplicaciones: biodiversidad en ambientes extremos, degradación de residuos agroindustriales, secuenciación de SARS-CoV-2.

Modulo Práctico: Análisis de amplicones y aplicaciones. Introducción al sistema operativo Linux. Análisis de comunidades microbianas utilizando QIIME2. Llamado de OTU/ASV y asignación taxonómica. Análisis de alfa y beta diversidad. Métodos estadísticos para la evaluación alfa y beta diversidad. Métodos multivariados para el análisis de comunidades microbianas. Identificación de biomarcadores e inferencia de las funciones con bases de datos. Glicósido hidrolasas, diversidad, estructura y función. Uso de herramientas básicas en el análisis genómico. Uso de bases de datos.