Metagenómica para Aplicaciones Industriales y de Salud
Director: Dr. Daniel Kurth.
Coordinador: Dr. Daniel Kurth.
Plantel Docente: Dr. Daniel Kurth, Dr. Ariel Fernando Amadio, Dr. José Matías Irazoqui, Dr. Julián Rafael Dib, Dra. María Alejandra Martínez, Dr. José Horacio Pisa, Dr. Juan Pablo Bustamante, Dra. Karina Antúnez Claustre y Dr. Eduardo Castro-Nallar.
Colaboradores: Lic. Virginia Marcelino y Lic. Hayde Saracho.
Contenidos mínimos
1. Módulo teórico:
Toma de muestras y diseño de experimentos. Métodos y sesgos de extracción de ADN. Tecnologías de secuenciación y su impacto en el muestreo de comunidades microbianas. Preparación y estandarización de bibliotecas. Estrategias de secuenciación: amplicones, metagenómica (Whole MetaGenome Shotgun Sequencing), metatranscriptómica (Whole MetaTranscriptome Shotgun Sequencing). Procesamiento de datos: Ensamblado y anotación. Microbioma humano en la salud y las enfermedades humanas. Microbiomas de abejas. Bioprospección enzimática. Degradación de residuos agroindustriales. Plasmidomas.
2. Módulo práctico:
Introducción al sistema operativo Linux y la computación en la nube. Análisis de un conjunto de datos de secuencia de amplicones de comunidades microbianas utilizando QIIME2. Identificación de OTU/ASV y asignación taxonómica. Análisis de diversidad alfa y beta. Métodos multivariados para el análisis de comunidades microbianas. Identificación de biomarcadores e inferencia de funciones con bases de datos. Análisis de datos de “shotgun” con un enfoque basado en ensamblaje. Genomas microbianos ensamblados (MAG). Anotación. Clasificación de glucósido hidrolasas para la degradación de residuos agroindustriales: diversidad, estructura y función.
Información del Curso de Posgrado
Organiza:
Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos (PROIMI – CONICET).
Informes:
Dr. Daniel Kurth. PROIMI – CONICET
Av. Belgrano y Pje. Caseros, S. M. de Tucumán.
Telefono: 543814344888 int 22
Mail: dkurth@conicet.gov.ar